Barbara Halfter wurde in Stadthagen (Niedersachsen) geboren. Nach dem Abitur studierte sie von 1987 bis 1991 Violine an der Hochschule für Musik und Theater Hannover bei Prof. Atila Aydintan und von 1993 bis 1995 an der Rubin-Academy der Universität Tel Aviv bei Prof. Yair Kless. Gleichzeitig mit dem Musikstudium belegte sie Studiengänge an der Universität Hannover in den Fächern Biologie und Germanistik. 

Am Studio für Alte Musik der Musikhochschule Hannover unter der Leitung von Lajos Rovatkay sammelte sie wichtige Erfahrungen im Bereich der historischen Aufführungspraxis und dem Spiel der Barockvioline. Bis zu ihrem Umzug nach Berlin im Jahr 2000 war sie außerdem Mitglied in dessen Ensemble, der Capella Agostino Steffani. 

Seit 1993 bis heute spielt sie regelmäßig mit der Akademie für Alte Musik Berlin und ist nun schon fast 20 Jahre Mitglied des Orchesters, dessen Tourneen sie bislang in fast alle europäischen Länder, nach Japan, Mittel- und Südamerika und Australien führten.  

Der Berliner Barock-Compagney war sie viele Jahren als regelmäßiger Gast künstlerisch verbunden. In beiden Ensembles war sie an einer Vielzahl von CD-Produktionen für die Label harmonia mundi France und Capriccio beteiligt. 

2011 war Barbara Halfter Gründungsmitglied des Cornelis-Quartetts, eines der wenigen Streichquartette, die sich dem Originalklang des 18. und 19. Jahrhunderts verschrieben haben.  

Seit 2024 ist sie an der Kreismusikschule Oranienburg als Violinpädagogin und Orchesterleiterin engagiert. Außerdem gibt sie regelmäßig Kurse an der Musikakademie Rheinsberg.